Название состоит из двух корней: ын ʽпологʼ, э ʽместо вдоль рекиʼ. Село Нынек расположено на реке Умяк (Умэгор). Удмуртское население, проживающее в этих местах, относилось к большому Пельгинскому племени. Об этом говорят многие названия современных удмуртских деревень. Они есть в некоторых районах Удмуртии, а также на территории Татарии и Башкирии. Вот названия близлежащих деревень: Арвазь-Пельга, Махан-Пельга, Пельга (одно из названий деревни Малый Кармыж).
Второй вариант происхождения названия: Ынэг – дохристианское личное имя ~ патроним, восходящий к общепермскому периоду. Нынек/Нынег – руссифицированная форма удм. Ынэг.
Возле д. Ынэг выявлен один из древних археологических памятников на территории Удмуртии эпохи мезолита (VIII–VI тыс. до н.э.).